Разлика почти няма, можете да го направите и по двата начина, просто когато е група, можете да извадите един елемент от нея, но в крайна сметка нали ги обединявате в един така че няма особена разлика. Аз бих си запазила един изходен леър, ако се наложи да се върна в началото (например може да се мултиплицира някоя малка грешка, вместо да се мъча да я оправя навсякъде с clone stamp, ще се върна в началото ще коригирам каквото съм видяла и отново ще клонирам всички).

Аз опитах с Merge и след това като променях "дизайна" в малкото квадратче и Save не се получаваше нищо..