@Анета
след като още по-подробно разучих темата, се оказа, че това е известен бъг на Autodesk и не работи във версии 2010 и 2011. В service pack за 2010 и 2011, както и в 2012, 2013 е оправено.

От Autodesk предлагат "заобиколно" решение, което не мога да пробвам, понеже нямам 2010, но може да го пробваш:

1. Създай нов групов филтър
2. Активирай съществуващ XREF филтър и кликни отметката "invert filter" (само слоевете, които не са в XREF се показват)
3. Избери тези слоеве, които искаш да са във филтъра и ги придърпай в него;
4. Влез във филтъра и махни отметката "invert filter"